一、股东大会决议通过并成立清算组清算后方能向各个政府部门申请办理注销手续。上海自贸区公司注册注册流程依次为：查名（确定公司名字）→开验资户→验资（完成公司注册资金验资手续）→签字（客户前往工商所核实签字）→申请营业执照→申请组织机构代码证→申请税务登记证→办理基本帐户和纳税账户→办理税种登记→办理税种核定→办理印花税业务→办理纳税人认定→办理办税员认定→办理发票认购手续。

具体流程如下：公司清算组备案(工商局)；刊登注销公告(发行报纸)；注销国、地税税务(shuìwù)登记(registration)证(国、地税局)；基本户注销（开户银行）；工商局受理、注销(工商局)；注销组织机构代码证（技术质量监督局）；缴销公章会计章

二、公司清算组备案（境外公司代表处无需成立清算组）。

1、公司备案申请表（公司清算组负责人签署）；

2、指定代表的证明(zhèng míng)（加盖公司公章）；

3、股东会关于成立清算组的决议（全体股东签署）；

4、公司营业执照副本复印件。

三、注销国、地税税务(shuìwù)登记(registration)证。

1、国、地税税务(shuìwù)登记(registration)证；

2、所有国、地税有关的材料(Material)；

税务(shuìwù)注销好由公司会计人员办理，填写相关表格税局专管员做完公司帐务巡查后方可办理税务注销手续。

四、基本户注销。上海代理注册公司公司的经营范围由公司的章程规定，公司不能超越章程规定的经营范围申请登记注册。

1、公司营业执照正本(有些银行要工商、代码、国税、地税全套证件）；

2、开户许可证；

3、印鉴卡；

4、印鉴卡上预留印鉴；

5、支票本、电汇凭证(voucher)等银行相关材料(Material)；

6、销户申请书。

五、工商局受理核准注销后并领取注销通知书。

六、向组织机构代码中心申请组织机构代码证注销并领取注销回执。

七、向公安局缴销公章、会计章。上海代理注册公司公司的经营范围由公司的章程规定，公司不能超越章程规定的经营范围申请登记注册。